nce hangi pathwayeleri sececegine karar ver
sonra bu pathweyere ait olan sifleri birlestir.
Her zaman da  bu dosyann belirli bir ksmn background gene yaparak microarray ret
bu microarrayleri retirken soyle yapcaksn
""""""""istemedigin her geni aa kopyala ve 'bgr_' yaz nne 
bgr_ li genler iin elde ettiin sinyal deerlerini orjinal genler iin elde edlien sinyal deerleri stne overwrite yapip.
bgr_ li genlerin satrlarn siliyorsun. """"""""""
syntren kullanmak istiyorsan bunu haluk un gosterdigi gibi Syntren den yapmalisin 
onu da soyle yapicaksin
"""""""  java -jar target/syntren-0.0.1-SNAPSHOT.jar """""""""""

 suan icin sif1,sif2,sif3,sif4 uretelim
 evidence file larn retelim

*MAC de sifler ile SyNTren altrcaksn conf.yaml dosyasn deitirmeyi unutma
java -jar /Users/business/Downloads/umut-1/target/syntren-0.0.1-SNAPSHOT.jar

Syntrenden sonra geneexpressions genlerin satrlarn yer deitirmeyi unutma 

*syntren.conf dosyasnda baz deiiklikler yaptik onlari bir sor dogru olmusmu?

*sifnames_number_genes_paths.m  dosyasnda path leri deitirmeyi unutma,